Ciências Genômicas e Biotecnologia

Área de Concentração: CIÊNCIAS GENÔMICAS

Linhas de pesquisa

BIOLOGIA MOLECULAR DE MICRORGANISMOS, PLANTAS E ANIMAIS

Organização de material genético em procariotos e eucariotos. Estrutura e caracterização de genes. Manipulação genética de microrganismos. Transcriptoma e análise de expressão gênica. RNAs não-codificadores e regulação. Interação patógeno-hospedeiro. Prospecção e análise de genes. Proteínas relacionadas a defesas em animais e plantas.

GENÔMICA DE MICRORGANISMOS, PLANTAS E ANIMAIS

Mapeamento de genoma estrutural e funcional. Estrutura do genoma eucarioto e procarioto. Montagem de contigs. Análise de sequencias em bancos de dados e anotação. Disponibilização de dados genômicos.

Área de Concentração: BIOTECNOLOGIA MOLECULAR E CELULAR

Linhas de pesquisa

BIOINFORMÁTICA APLICADA À GENÔMICA E PROTEÔMICA

Análise de sequencias biológicas. Montagem e Anotação de genomas e metagenomas. Transcriptômica e Identificação de variações genéticas. Árvore filogenética. Busca em bancos de dados. Construção de bases de dados biológicas. Bioinformática estrutural, Modelagem, Docking e Dinâmica Molecular. Predição de estrutura secundária e terciária de proteínas.

BIOTECNOLOGIA/NANOTECNOLOGIA APLICADA À SAÚDE HUMANA, ANIMAL, VEGETAL E MEIO AMBIENTE

Identificação de novas moléculas bioativas antimicrobianas, antitumorais, anti-envelhecimento, nanoestruturação de moléculas bioativas, caracterização de nanoestruturas biocompatíveis e biodegradáveis. Desenvolvimento de produtos/processos aplicados à saúde humana, animal, vegetal e ambiental.

EMPREENDEDORISMO, PROPRIEDADE INTELECTUAL E GESTÃO DE NEGÓCIOS EM BIOTECNOLOGIA

Como empreender em negócios em biotecnologia, Desafios para estruturar uma startup em biotecnologia, Gestão de Propriedade Intelectual. Legislação nacional e internacional. Busca de patentes em bases de dados nacionais e internacionais. Redação de patentes. Regulatório para produtos e processos em biotecnologia aplicada a saúde humana, animal, vegetal e ambiental.

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LABORATÓRIO DE BIOLOGIA MOLECULAR

Laboratório de Biologia molecular está organizado com 7 conjuntos de bancadas, permitindo 14 espaços contínuos de trabalho. Conta com todos os equipamentos necessários para purificação, amplificação e clonagem de DNA e RNA como cubas de eletroforese em gel de agarose, sistema de eletroforese Pulse Field, sistema de fotodocumentação, termocicladores, sistema de PCR em Tempo Real (Step One – Applied Biosystems), microcentrífugas, banhos-maria, banhos secos.

LABORATÓRIO DE SEQUENCIAMENTO DE DNA

O laboratório é equipado um Sequenciador de DNA pelo método de Sanger (ABI3130XL de 16 capilares) além de um sequenciador da família de Next Generation Sequencers da empresa Illumina (Myseq), um equipamento de sequenciamento em alta escala Ion Torrente PGM e um equipamento de PCR quantitativo Digital. Além disso, conta quantificadores de ácidos nucleicos de proteínas como Qubit e Nanodrop.

LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA

O Laboratório de Bioinformática da UCB desenvolve pesquisas utilizando ferramentas computacionais para a análise de sequências biológicas, com o objetivo de auxiliar a interpretação de dados. Dentre os diversos programas utilizados no momento, incluem-se softwares de construção de genomas e transcritomas, anotação funcional, análise de expressão diferencial, busca por similaridade de sequências em bancos de dados, construção de modelos estruturais de proteínas e simulações por dinâmica molecular. Este conjunto de ferramentas é necessário para a integração e análise de dados genômicos e proteômicos, bem como para o suporte a linhas individuais de pesquisa. O laboratório conta atualmente com excelente infraestrutura, incluindo dois servidores Dell com 727GB e 251GB de RAM, além de vários equipamentos PC disponíveis para os estudantes do programa.

Serviços atualmente disponibilizados pelo Laboratório de Bioinfomática:

– Análises de dados de sequenciamento em larga escala (Montagem e Anotação de genomas e metagenomas, Análises de Expressão Diferencial, Caracterização Transcritômica e Identificação de variações genéticas);
– Utilização de ferramentas de Bioinformática Estrutural (Modelagem, Docking e Dinâmica Molecular) para estudos de estabilidade proteica e para análises de impacto de variações pontuais em estruturas proteicas.

LABORATÓRIO DE PROTEÔMICA

O Programa de Pós Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia conta com um espaço denominado Centro de Análises Proteômicas e Bioquímicas. Este espaço tem uma área de 120m2 e conta com os seguintes equipamentos: 2 cubas de gel para desenvolvimento de eletroforese bidimensional, espectrofotômetro.

LABORATÓRIO DE PURIFICAÇÃO E ESPECTROMETRIA DE MASSA

O laboratório de purificação de moléculas e espectrometria de massa conta com 4 cromatógrafos de alta performance (Shimadzu), 1 cromatógrafo de fase aberta (Akta Avant 25), bem como dois espectrômetros de massa (MALDI-TOF/TOF e ESI-Q-TOF, ambos da Bruker Daltonics), liofilizador, concentrador rotatório de amostras, ultrafreezer vertical – 80C, com capacidade de 727 litros.

LABORATÓRIO DE FERMENTAÇÃO E ESCALONAMENTO

O laboratório de fermentação e escalonamento conta com 3 shakers refrigerados para o cultivo de microrganismos, câmara de fluxo laminar, centrífuga de fluxo contínuo, fermentadores com capacidade para 1,3 litros; 3 litros, 14 litros e 125L.

LABORATÓRIO DE CITOMETRIA DE FLUXO

A sala conta com citômetro de fluxo modelo FACSCalibur da BD para análise de variados tipos celulares.

INFRAESTRUTURA GERAL

No espaço de aproximadamente 300 m2 térreo do Prédio João Paulo II estão localizadas as seguintes espaços:

• Câmara Fria
• Almoxarifado Central
• Sala de preparo de soluções equipada com balanças de precisão, agitadores magnéticos e capela de exaustão;
• Sala com freezers -80 (atualmente com -4 freezers, sendo 3 de 480L e um de 690L). Essa sala também está localizada uma ultracentrífuga.
• Sala para lavagem e esterilização de vidraria, equipada com duas autoclaves verticais e uma horizontal e uma estufa de secagem de material. Estão localizados os sistemas para purificação de Água; Bidestiladores e Sistema de ultrapurificação de água Millipore – Biocell;
• Salas para manipulação de microrganismos compreendem:
• Sala equipada com um fluxo laminar classe II A para manipulação de fungos não patogênicos;
• Sala equipada com 2 fluxos laminares de classe II B2 e 1 de classe B1, sistema de exaustão, estufas incubadoras e uma estufa de CO2. Este espaço é designado para o crescimento de microrganismos com nível de biossegurança NB2;
• Sala equipada com 3 capelas de fluxo laminar classe B1, eletroporador, centrífuga refrigerada e estufas incubadoras para trabalho com clonagem em bactérias com nível de biossegurança 1;Sala para cultura de células: equipada com 2 fluxos laminares classe II B1, sistema de exaustão, e uma estufa de CO2 para o crescimento de células animais e microscópio invertido Zeiss AxioVert40 CFL.

• Sala de microscopia óptica: dispõe de microscópio óptico de contraste de fase AxioLab.A1, microscópio de fluorescência AxioImager.M2 ambos acoplados e sistema de aquisição de imagens.
• No térreo ficam ainda 5 incubadoras refrigeradas com agitação, uma máquina produtora de gelo em escamas e uma ultracentrífuga.

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Mensalidade Bruta: 48 x R$ 2.087,73*

Mensalidade com Desconto Comercial: 48 x R$ 1.816,33**  

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*O valor bruto da mensalidade sofrerá reajuste anual.

**Consulte condições com a equipe comercial.

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Confira a matriz do Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Ciências Genômicas e Biotecnologia da UCB.